Иван Фёдорович Ходкевич родился около 1420 года, более точной даты не известно. Он был сыном Ходки (Фёдора) Юрьевича, Киевcкого боярина и родоначальником рода, который в 1432 году подписал вместе с другими акт Гродненской унии между ВКЛ и Польшей.
О детстве, юных годах и образовании Ивана Федоровича, ничего не известно, сведения о нем сохранились лишь благодаря его государственной и военной деятельности. Так в 1453 году для исправления унии и возвращения Подолья и Волыни в состав ВКЛ, его отправили в польский город Прачев на сейм.
Далее в он принимает участие в тринадцати летней войне Польши с Тевтонским Орденом, где в армии ВКЛ воевал в 1458 и 1466 годах. В 1470 году он был назначен на должность Маршалка гасподарского в которой он пробудет до 1479 года.
Спустя четыре года в 1474 году его направляют в Чехию на помощь королю Владиславу Ягеллону, против бунтовщиков, где Ходкевич возглавил войска Литвы. Затем, 12 октября этого же года, он принимает участие в битве под Вроцлавам, против войск венгерского короля Матьяша Корвина.
В 1476 году Иван Фёдорович Ходкевич был назначен на должность Витебского наместника и Великого гетмана литовского. В это же году вместе с другими влиятельными государственными деятелями ВКЛ, он принимает участие к подготовке посольства к папе римскому, на тот момент им был Сикст IV. Целью посольства было получить признание равноправия православной веры, католической, а возглавить его должен был киевский митрополит Мисаил. Помимо подготовки, Ходкевич так же, вместе с другими участниками подписал письмо Папе.
В 1478 году Ивана Федоровича назначают старостой Луцким, а затем в 1480 году воеводой Киевским. Спустя год, 1 сентября 1481 года на Киев напал крымский хан Менгли-Гирей. Татарам удалось взять город и среди большого количества пленных оказался Ходкевич со своей семьей.
Он был в браке с дочерью князя Бельского Агнешкой Софией Ивановной, которая родила ему дочь Аграфену, и сыновей Александра и Якумилу. Из татарского плена вернулись только его жена, дочь Аграфена и сын Александр, их смогли выкупить. А вот самого Ивана Фёдоровича Ходкевича и его дочь Якумилу, видимо не успели, так как они умерли в татарском плену.